造成机箱屏蔽失效的另一个主要原因是穿过机箱的电缆。在实际中，很多结构上很严密的屏蔽机箱(机柜)就是由于有电缆直接穿过屏蔽箱而导致电磁兼容试验失败，这是缺乏电磁兼容经验的设计师感到困惑的典型问题之一。
判断这种问题的方法是将设备上在试验中没有连接的电缆拔下，如果电磁兼容问题消失，说明电缆是导致问题的因素。
解决这个问题有两个方法：
1)对于传输频率较低的信号的电缆，在电缆的端口处使用低通滤波器，滤除电缆上不的高频频率成分，减小电缆产生的电磁辐射(因为高频电流 容易辐射)。这同样也能防止电缆上感应到的环境噪声传进设备内的电路。
2)对于传输频率较高的信号的电缆，低通滤波器可能会导致信号失真，这时只能采用屏蔽的方法。但要注意屏蔽电缆的屏蔽层要360°搭接，这往往是很难的。
在电缆端口安装低通滤波器有两个方法：
(1)安装在线路板上，这种方法的优点是经济，缺点是高频滤波效果欠佳。显然，这个缺点对于这种用途的滤波器是致命的，因为，我们使用滤波器的目的就是滤除容易导致辐射的高频信号，或者空间的高频电磁波在电缆上感应的电流。
(2)安装在面板上，这种滤波器直接安装在屏蔽机箱的金属面板上，如馈通滤波器、滤波阵列板、滤波连接器等。由于直接安装在金属面板上，滤波器的输入、输出之间隔离，接地良好，导线上的干扰在机箱端口上被滤除，因此滤波效果理想。缺点是安装需要的结构配合，这在设计初期进行考虑。
由于现代电子设备的工作频率越来越高，对付的电磁干扰频率也越来越高，因此在面板上安装干扰滤波器成为一种趋势。一种使用方便、性能优越的器件就是滤波连接器。滤波连接器的外形与普通连接器的外形相同，可以直接替换。它的每根插针或孔上有一个低通滤波器。低通滤波器可以是简单的单电容电路，也可以是较复杂的电路。
解决电缆上干扰的一个简单的方法是在电缆上套一个铁氧体磁环，这个方法虽然往往，但是有一些条件。许多人对铁氧体寄予了过高期望，只要一遇到电缆辐射的问题，就在电缆上套铁氧体，往往会失望。铁氧体磁环的效果预测公式为：共模辐射=20lg(加磁环后的共模环路阻抗/加磁环前的共模环路阻抗)例如，如果没加铁氧体时的共模环路阻抗为100Ψ，加了铁氧体以后为1000Ψ，则共模辐射为20dB。
这说明有时套上铁氧体后，电磁辐射并没有明显的，这并不是铁氧体没有起作用，而可能是除了这根电缆以外，还有其他辐射源。
在电缆上使用铁氧体磁环时，应注意到下列一些问题：
①磁环的内径尽量小；
②磁环的壁尽量厚；
③磁环尽量长；
④磁环尽量靠近电缆的输入端头处安装。
